萧宝融是齐明帝萧鸾第八子，建武元年（公元494年）封随郡王，永元元年（公元499年）改封南康王，任西中郎将、荆州刺史，镇守江陵。
永元三年（公元501年）正月，萧宝融开始称相国，大赦。萧衍率大军自襄阳出发，东讨萧宝卷。萧宝融与萧颖胄留守江陵。三月，14岁的萧宝融在江陵即皇位，改元“中兴”，大赦，立宗庙与南北郊，州府城门全依建康宫城，置尚书五省，设百官，萧颖胄为尚书令，萧衍为尚书左仆射。又下诏废萧宝卷为涪陵王。
萧衍连下郢州、江州，萧宝融下诏给萧衍，若平定京师，可便宜行事。这时，萧衍的弟弟萧澹自襄阳率兵赴江陵，萧宝融任其为荆州刺史。从此，萧宝融完全在萧衍的掌握之中。
十二月，建康城禁卫军倒戈，杀萧宝卷，迎萧衍入城。第二年，萧宝融遣使慰劳建康。萧衍在京，专权朝政，以大司马进相国，封梁公，又进封梁王，诛杀齐明帝萧鸾诸子，篡位之心昭然若揭。
三月，萧衍派人迎萧宝融东归，行至姑孰，萧宝融下诏禅位于梁。四月，萧衍称帝，奉萧宝融为巴陵王，在姑孰设宫，一切待遇从优，皆仿齐初萧道成称帝时奉宋帝为汝阴王之礼。后来，萧衍欲以南海郡为巴陵国，将萧宝融移去居住。沈约献计，古今这种大事，不能图虚名而受实祸。萧衍采纳他的意见，派亲信郑伯禽到姑孰，进生金令萧宝融自杀。萧宝融似乎早料到会有这么一天，所以并不惊慌，他镇定自若地说：“我死不需要金子，有醇酒就足够啦！”说完，取酒酣饮，直醉得不省人事，昏昏睡去，郑伯禽随后将他杀死。南齐最后一位皇帝，就这样死去了，年仅15岁。死后被追尊为“齐和帝”，葬于恭安陵。