那边究竟是个什么样的房间呢？既然是一个需要从画框后出入的房间，就绝对不会是一个简单的地方。
“不用怕，进去看看！……”
少年们精神十足。一把摘掉画框后，他们鱼贯进入了房间。
微暗的房间里，散发着霉臭的味道。虽然铺着榻榻米，但是已经全部烂掉了，一脚踩下去，晃晃悠悠的。
习惯眼前的黑暗之后，少年们先是注意到，这房间非常的大，然后看到的，就是正中的铁格子。
与其说是铁格子，不如说是铁笼。铁笼连接着房顶和榻榻米。
“啊！笼子中有人！……”二宫发出了悲鸣。
“什么？……人？……”
大家提心吊胆地接近笼子，向内看去。确实可以看到一个穿西装的人，倒在地上。
是谁呢？四本用手电照了照那人的脸。
“啊呀！已经变成白骨了！……白骨还穿着西装！……”孩子们吓得惊叫起来。
“手也已经变成白骨了。”
笼中的死者，也是一名囚人吧。而且年代相当久远了。从他穿着西装这点来看，也许是外国人，或者是当时比较新潮的人。
“难道，这是雅利乌斯的尸体吗？”六条突然像灵光一闪般地说。
“雅利乌斯离开了这宅子，应该不是他。”五井推理说。
“但是，据说离开这里之后，雅利乌斯就再也没有消息了。所以，如果他死在这里，也说得通。”四本提出了新设想。
这时，八木指着笼子里说：“你们看，在白骨的右手旁，有一本好像是笔记本一样的东西。我们把它拨过来看看，应该能够明白一些东西。”
八木的发现很有趣。他们用木棒，把那笔记本拨了出来。打开一看，果然写着很重要的东西。那就是外界全然不知道的，这时钟大屋里的惊天秘密。
要点大概如下：
因为所犯下的罪过，我受到了上天的恁罚，让我在这笼中活活饿死。
为了忏悔，我将自己的可怕罪过，写在这里。我对我的主人——雅利乌斯所持有的辉钼矿石，艳羡不已，想要占为己有。在得知辉钼矿石的所在地之后的一天晚上，我在雅利乌斯的寝室里，突然袭击了他，将他捆绑起来，用铁链锁住，关入了地下室，并在他脸上覆盖了死神面具。
对外，我宣称雅利乌斯已经离开了此处，并遣散了全部仆人。这花掉了我很多钱。
等到终于一个人待在这房子里的时候，我以为：我已经独占了这巨大的財富。可是，我进入屋后，我到我所以为埋藏着辉钼矿石的地方一看，却是我弄错了！原来，那根本就不是矿石的所在。
我回到地下室，向雅利乌斯逼问矿石的下落，可是，他无论如何都不肯说。
因为经济困顿，我不得不把房子卖给左东左平。拿到钱后，我装作离开这里，实际，却通过密道，回到屋中。
这所宅子里，根据雅利乌斯的喜好，设置了很多机关暗道。我对左平隐瞒了这事，自己找了间秘密房间，住了进去。
然后，我一边继续逼问雅利乌斯，一边自己调查各种资料，想要找出矿石。也不知道左平是如何发现，这座房子里，除了他的家人，还有外人的。他开始热心探寻这里的秘密。
因为怕他找到这房间，我只好用各种手段去恐吓他。在用了很多可怕的办法之后，我先是杀掉了左平的妻女，后来，又杀了左平。把他的妻女放在棉被里，布置成睡觉的样子，将左平吊在钟表旁边。这些全部是我做的。
我的目的，是为这宅子制造怪谈，这目的达到了，村里的人，看到了左平一家的惨状，惊吓不已。时钟大屋的怪谈，也就流传开了。
但是，上天的惩罚也降临到了我的身上。我发现了雅利乌斯的绝密实验室，接着，通过画枢，找到了这间房间。在我想要掀开榻榻米、查看下面的时候，铁笼从天而降，把我拘禁在这里。那就是我噩运的开始。
我想了各种办法，要逃出笼子，全都失敗了。这大宅之中，除了被关在地下室的雅利乌斯和我，再无他人。村人因为害怕这里，都不敢靠近。我寄希望于自从左平死后，就停摆的大钟，祈祷它能重新走动，把村里人都召唤到这里，可是，到死我也最终没能实现。
我知道，这就是上天降罚于我。现在，我只能等待死亡，忏悔自己的罪过，祈求原谅。
我最后的希望，是能够有人到地下室，救出雅利乌斯，可是，也很难实现。我使得雅利乌斯和我一样被活活地饿死。最后，杀死主人的罪过，降临到我头上。意识到这些，我对自己所犯的可怕罪孽，感到万分害怕。
神啊，请你救赎我的炅魂吧。
明治碎年十二月
门田虎三郎
大团圆
这竟然是门田虎三郎的遗书！……
倒在笼内变成白骨的，赫然竟是门田虎三郎！……
啊……他究竟是谁呢？……
记忆力强的读者，回叙还记得，门田虎三郎，就是雅利乌斯的家仆。
“这事情真可怕啊！……”五个少年面面相觑。
“但是，这时钟大屋的秘密，终于解开了。”
时钟大屋的秘密解开了。
是这样吗？不对，坏人门田仆人的遗书，只是解开了一部分的秘密。门田所不知道的秘密，在这大屋中还有很多。
辉钼矿石被埋藏在哪里？
雅利乌斯的结局最后如何？
这和八木君在地道里见到的、蒙着死神面具的怪人之间，又有什么关系呢？
……
他们绝不可能是同一个人。如果，雅利乌斯活到现在，应该早就过了百岁，这怎么可能呢？
北岸他们，现在又在哪里呢？
那个大钟敲响四点时。就会爆炸……啊，又是真的吗？
如果是真的，那么，这又是谁设置的机关呢？
如果是雅利乌斯，那又为了什么？
……
这样推论的话，时钟大屋里，还隐藏着很多秘密，不知何时才能全部解开。
但其中之一，很快就被解开了。
二宫的耳朵很灵，他很快听到这房间里有某处，传来咚、咚、咚的细小声音。五个少年在房间中，四处寻找声音来源，发现是从天花板的一隅传来的。那里还有些微的尘土一直滑落。
“啊！天花板里有人！”
用了一番办法，他们终于把天花扳里的人救了出来。原来，是失踪了一段时间的北岸等七个村人，他们差一点就被饿死了。
他们用虚弱的声音，描述了之前的遭遇。
进入这宅子之后，他们在各个奇怪房间巡视走动时，忽然，从地板上掉入了这个房间，被关在了里面。墙壁很高，无法逃出，一直被关到现在。
北岸叔叔他们表示，希望能尽快离开大屋，早点看到日光，呼吸新鲜空气，喝到新鲜的水。
少年们遂往返数次，两两挣着他们，将他们带出了时钟大屋。最后，当八木和四本搀着北岸离开房子时，地震又袭来了。震度相当强，一定是刚才地展的余震。
三人一边说着地震的事，一边向院子中走去。八木忽然说：“安静！你们听！……”
他放开北岸叔叔，两手拢在耳边，仔细倾听，忽又抬头看向大钟。
滴答滴答滴答！……耳边传来的是微小的声音。
“坏了！那个大时针又开始动了，快跑！……”
刚才的余震，可能破坏了老旧的细绳，使得钟摆又开始摆动了起来。
“完了！时钟大屋要爆炸了，快伏到沟里去！……”
时针开始走动之后，只要一分多钟，就会发生大爆炸。因此，大家如此惊慌，也就不难理解了。
果然过了一分钟多一点，爆炸就发生了。冲天的灰尘慢慢落定之后，大家发现，刚才的时钟塔，已经不知被炸到哪里去了。让人看得不禁后背发冷。
五个少年和七个村人，差一点点就遇难了。
故事到此，还没有结束，还有两件事情必须要说。
其中之一，是救过八木性命、告诉他时钟大屋秘密的那个怪囚人，后来八木在铺着玻璃地板的地下室里，找到了铁链和死神面具，但是那人却不见了。
怪囚人后来如何了？这个秘密至今也未解开。
“那也许是雅利乌斯的幽灵吧。”八木最后下了这个结论。
“不对吧，你都快被掩死了，因为恐惧而晕倒，产生了幻觉，所以，才会觉得你见过那人。”四本这么认为。
“不知道是怎么回事呢。”
“总之是很奇怪的吧。”
“世界上不是每件事都有答案的，”
“找到辉钼矿脉，实在是意想不到的大发现啊。”
于是，少年们爽朗地笑了。