十二月初七，天阴沉沉的，象是要直压到地上来似的。翁同龢从中南海仪鸾殿见了慈禧回来，刚在家中喝了一口茶，有人来报刑部浙江司郎中翁同龢的侄子翁曾桂前来拜见。翁同龢急忙叫人把他请进来道：“案情进展如何？什么时候开棺验尸？”
翁曾桂道：“不好了，叔父大人，开棺的事有点儿不妙。有人到刑部发话，反对开棺验尸。”
“是谁？”
“四川总督丁宝桢。他这几日正在京中办事。昨天他跑到刑部大发雷霆，面斥刑部尚书桑春荣老耄糊涂。又到处扬言，说这个铁案如果要翻，将来没有人敢做地方官了，也没有人肯为皇上出力办事了。”
丁宝桢并非是见钱眼开的人物，此人在做山东巡抚时曾杀过慈禧太后得宠的太监安德海。慈禧不但不报复他，反而夸他清廉刚直，后来吴棠出缺，慈禧便将丁宝桢擢为四川总督。用他去整饬被吴棠搞坏了的四川吏治。提起丁宝桢，朝中一般的京官都有些怕他。这一回丁宝桢插手此事，的确有些麻烦。翁同龢的心不禁一阵紧缩，他低头不语，想了一会儿才道：“你不用害怕，朝廷既然谕令刑部全权办理此案，咱们就放心去做。此案若天下大白，丁宝桢也没有什么可说的了。你们定在什么时候开棺验尸？”
“十二月十二。”
“夜长梦多，时间长了恐生变故，要提前验尸。明天是来不及了，就定在十二月初九吧。”
初七这晚，纷纷扬扬的大雪铺天盖地的下起来，一下就没个完了。到初八晚上，仍是停不下来，眼见得碎玉乱珠、扯棉丢絮般的大雪没有要歇的意思，夜幕下泛着幽幽的白光，翁同龢着实有些心慌。这雪若是还不停，初九开棺又要推迟，拖的时间久了，恐生事端啊。
到了第二日晨，竟然红日初升，将朝阳门外盖了一层雪被的田野阡陌都映的红了。朝阳门外宛平县的海慧寺，天寒地冻也挡不住纷至沓来的看客。早在卯时初的时候（凌晨五点）步军统领衙门派出的兵丁，就把寺庙内外围得紧紧的。接着刑部各位堂官、司官也乘着绿呢大轿、蓝呢大轿陆续来了。翁同龢也早早来到海慧寺压阵，坐在大殿偏厢里，静候时辰。
巳时四刻（上午十点钟），开棺的时辰已到。众人来到公堂之上。
公堂设在大雄宝殿关的平台上，香烟缭绕，铺着黄缎罩缦的长桌，翁同龢与刑部诸官并坐。司官八人，仵作二人，差役十余人，分列于大殿左右。杨乃武案中的一干证人及原被告也被带到现场见证。
葛品连的棺木抬到了殿前的空地。数百双眼睛都盯在这个被五十六道封条包裹着的棺材上。开棺之前，先由刑部八个第一流的仵作对封条验定，揭封之后，又叫刘锡彤认明原棺无误。负责督验的翁曾桂才喊了一声：“开棺。”
四个差役手挥斧钎，砰的一声撬开了棺盖。那棺木已经入土数年，四角已腐朽，随着棺盖滑落，也朴簌簌的掉下黑黄的木屑。一股尸臭顿时从棺中弥漫出来，幸亏事先已在庭前大香炉内焚起黄熟、檀降两种香料，才将尸臭压住。
首席仵作秦德山已经八十一岁，是翁曾桂特地派人花重金聘来的，他的徒弟将尸首轻轻抬出。只见尸体皮肉大多腐化，仅留一点腐肉留在骨上。秦德山走过去，用布满青筋的手捏了一根银针，飞快的插入死者喉间，轻轻捻动了一下，又缓缓抽出，用皂角水洗净。如此反复多次，银针上并不显示黑色。他又取铜盘一个，用榔头敲下一块黑色的囟门骨，映日细看了一会儿。如此验了半日，报到：“验得该尸卤门骨并无红晕浮出，喉骨、牙齿、牙龈、胸部龟子骨、手指骨、足趾骨及周身大小骨殖均呈黄白色；凡服毒者，囟门骨必定里外皆黑色。而此尸囱骨为黄色骨头，外面受潮霉变发黑，内里却莹白。不仅如此，该尸所有骨殖无一处有毒黑之色，很显然，此人一定没有中过毒。”
翁曾桂问道：“那么，余杭县仵作沈祥用银针发黑又是什么缘故呢？”
“大人，判断一个人是否中毒，可以用银针来探死者的喉部。如果银针没有变色，可作无毒的结论。但银针变色，却不能轻易下结论。因尸体发生腐烂之后，就会产生尸气（就是硫化氢），这个东西也能使银针变黑。所以必须要用皂水来擦洗，如果皂水能去尸气，如果擦洗不掉才能证明是中毒。即使经皂水银针验出中毒，还应当结合其他的症状来判断验实。”
“这么说，葛品连不是中毒死的？”
“我作仵作六十多年了，敢打这个保票。”
秦德山在尸格上画了押，翁曾桂又叫八名京中仵作复验，个个验过都说无毒。再叫余杭原验仵作沈祥复验，问他有毒无毒，沈祥口称愿领审验不明之罪。再看刘锡彤，此时已经是气焰始落，面色惨白，全身发抖。
围观的看客顿时欢呼雷动，有的喊“青天有眼”，有的喊“断案如神”，一个法国记者也跑到关着杨乃武的囚车木笼旁，操着半生不熟的汉语笑着道：“无毒，无毒。”
后来，这个记者在一篇发往欧洲本土的通讯中，以“中国奇案，寺内开棺”作标题，刊载了消息。其中有一句是“大殿边的小屋子，木笼里关着两个穿红色囚衣的犯人，一个是杨乃武，一个是毕秀姑。”
此时，从跪着的证人中冲出两个人，直冲到刘锡彤的面前，要与他拼命。早有眼疾手快的差役一把将两人扯住，虽然不能近前，两个人对着刘锡彤仍是痛骂不止，悲愤之极。翁曾桂见是杨乃武的妻子杨詹氏和姊姊杨菊贞，叹了口气，只叫人把两个人带了下去，吩咐不准难为她们。
海会寺验尸后，案情已经大白，刑部立即将复审勘验情况，奏知两宫，这时才将刘锡彤革职拿问。
刑部对刘锡彤无故入人以罪、原审各官审办不实等事又进行了几次大规模的审讯，这一回所审问的人犯已经不是普通百姓而是大清官员了。