一开始的时候，搜查本部单纯是为了追究计划制定人的刑事责任而设设的，调查也是预计集中往“实验在哪个阶段有过失”上面。
可是，现在又出现了有人为了扩大山石崩坍的规模，在夜间偷偷地把水，灌进了断层地带的怀疑。假若如此，这与仅仅怀疑因业务过失，而引起的死伤，是不能相提并论的，这是重大的预谋型犯罪，是大量的杀人嫌疑。不用仔细说，搜查本部充满了紧张感。
是先行公布这一新的事实，然后再公开进行调查？还是作为极端重大的秘密，把它暂时隐瞒下来，进行秘密调查？两种意见经过交锋后，结果决定了秘密调查的方针。
搜查本部——包括县警察本部的成员，虽然一下子增加了三倍，但是，这些人的出入，却受到了严格的控制，意在不让新闻记者有所察觉。
调查前线的指挥——小笠原警视把搜查人员分为两班，第一班是“调查班”，由米田共警部任班长；第二班是“动机班”，班长是内川警部。
第一班以各部刑警部长官牵头，分成若干个小组后，立即开始了调查活动：八月六日和七日的夜晚，有没有可疑的人，出现在现场的附近？有没有带着胶皮管和铁棍的人，悄悄进入公园？午夜十二点以后，有没有人或车辆，从公园里面出去？……就以上这几个问题，他们虽然以现场监视小屋的值班员、公园小卖铺里的售货员、公园的警卫人员、日本民家园的警卫人员、公园附近的居民，和巡逻警察为对象，进行了严密的调查，但是没有取得明显的收获。
监视小屋的值班员说：“那两天，直到傍晚，都有男女结伴而来散步的人，但是，并没有发现什么行迹可疑的人。也没有看到手里拿着胶皮管子的人。就是你们所说的‘日本民家园’的警卫人员，在八点前后看到，上面有手电筒的光亮，我也是不能完全肯定的。尽管说那是事实，但是从下面的小屋往上看，那里却是死角，所以，我是无法看到的。”
公园小卖店的老太婆说道：“到六点我就关门回去了，所以，往后的事情，我可是不知道呀。是胶皮管子吗？要是胶皮管子的话，那只有插在水龙头的那一截儿。这儿没有那么长的胶皮管，兴许公园事务所有吧。”
公园事务所办事员说：“洒水用的长胶皮管，这里倒是有过，可是，由于它太陈旧了，多处漏水，所以，大约在十天前，把它当做废品给处理掉了。处理时，把它全部切成了一米长的碎段。至于新的皮管子吗？……是啊，预计这两、三天就能到货……”
公园的警卫人员回答他们的是：“成双成对步行的人，是不会呆到那么晚的。不过，在乘车来的人们当中，倒是有逗留到深夜一、两点钟出去的。八月七日夜晚……不，确切地讲，那已经是八日的凌晨了。那天早晨三点多钟，有一辆车开了出去。虽然没有开顶灯，但是在公园常夜灯的灯光下，还是可以辨认得出，他是一个男人。是啊，凌晨三点多钟出去，在附近也许是独一无二吧。所以，我现在仍然记得……嗯？橡胶皮管子似的东西？不，没有看到有那样的东西呀。因为我本来就没有向车中张望过。至于车子的牌号吗？遗憾得很，那个也没有注意呀！”
日本民家园的警卫人员的证词是；“在现场勘查的时候，我已经跟大家讲过了，是否需要讲得再详细点？是啊，最初发现的时候，手电的亮光是照在地面上。好像是在拨开地面的草丛，在寻找什么丢失的东西似的。然后，那把手电筒的光亮逐渐升高，照亮了人的周围。啊……是男是女，还有穿着什么样的服装？……唉呀，那些我根本不知道……之所以这么说，是因为除了光亮微弱外，它还在一晃一晃地乱动，不是一直照在一个地方嘛。第二次看到时，正是我巡夜结束，该返回去的时候。这时，我只是在想：‘哎，又开始干了’。”
公园附近的巡警说：“是六日和七日的晚上吗？”他想了想说，“八月六日，在公园入口的稻生桥交叉路口，只发生过一起轻微的车辆相撞事故，除此之外，没有发现其它怪异的事情，以及可疑的人呀。啊，你是说时间吗？因为是傍晚七点半钟，还不能算是晚上吧。从公园出来的一个女人，在交叉路口，匆匆叫住一锏出租车，坐了进去。出租车刚起动，便和柺过来的私人汽车，蟛地一声狠狠顶撞在了一起。两位司机下车后，发生丁口角。我赶去以后，由于相撞的程度颇为轻微，他们俩打算互不追究对方的责任，就这样算了。于是，两辆车便各自开走了。是那样，那个女人确实是从公园走出来的……不，没有结伴同行的男人；至于她的年纪吖，看上去像是有二十八，九岁的样子。服装我记得很清楚，半袖连衣裙，图案是黑白两色的千鸟方格，V字型的领口，袖边还镶嵌着细红条儿。啊？……不，我的爱人在家当裁缝，所以，对女人的时装，还是颊为懂行的。”
在把搜查一课改编为搜查主体的扩大调查会议上，这一事件的“动机”问题，很快就成了会议的主要焦点。尽管在结果上，是形成了大量杀人，但是罪犯的目的，显然并不是想杀死全体成员，可能是其中的一个人或几个人。也许是杀人犯的主意已定，为了杀死一个人或几个人，就是把许多人株连进去，那也没有办法。
那么，它的“动机”是什么呢？
可以考虑的，首先是所谓的怨恨、复仇、自卑感、优越感等“感情犯罪”，“物资性的利欲犯罪”则难以想象。不过，即使在“物资性的利欲犯罪”中，也要有在威胁面前，保全自己，或者是保全秘密的动机。除此之外，虽然也有杀人狂，和游戏犯罪等异常心理的犯罪，但是，必须看到：这种可能性总体来说很小。
以上，是搜查本部对“犯罪动机”上的基本看法。因此，只要是大体上顺着这条线索，调查出牺牲的十五个人的生前情况，以后就能找出它的“动机”来。
动机班班长内川警部，把所属的搜查人员，分成了三个小组。第一组，负责调查综合防灾研究所，以及建设将土木研究室；第二组，负责调查通产省地质凋查室，和自治省消防技术研究所；第三组，负责调查其它部门（有关新闻人员和公园内部工作人员等）的犯罪关系。
刚一开始调查的时候，有人提出意见说：“限定只调查死者的周围情况，有欠妥当。罪犯所瞄准的目标，不见得已经死了吧。”
于是，决定调查的对象，扩大到轻重伤者和幸免于难的人身上。